Bien pues pude encontrar una solución en "dd" Partimage no me sirvio de mucho, Mongo tampoco y que decir de g4l no me ayudaron para nada.
lo que sirvio fue:
1. Bootear desde el instalador de Debian.
2. Alt+F2 luego de la detección de la red.
3.
dd if=/dev/sda of=/dev/sdb bs=1M
Tardo una media hora en pasar todo el sistema base pero al final termino correctamente y ahora el Disco viejo reposa en paz. mientras busco una solución a sus problemas.